半経験的分子軌道法として最も有名且つ最も歴史あるプログラムが、ここで紹介するMOPACです。MOPACは1983年にver.1が公開されて以来、二年に一度ぐらいの割合でバージョンアップを重ね、ver.5で初めてPM3ハミルトニアンが導入、ver.6でPM3ハミルトニアンが改良され、このver.5～6の辺りで急激に広まりました(たしか)。現在、無償で公開されているのはver.7(MOPAC93のβ版？)までで、それ以上のバージョン(93以降)は有償となっています。当サイトでは、現在無償で入手可能なMOPACの中で最も入手が容易で、信頼性のあるver.6を中心にデータを紹介しています。また、一部に比較で最新一歩手前のMOPAC2002ver.1によるデータも紹介しています。
MOPACの入力は、3つの部分――キーワード，分子構造データ，追加データ――で構成されています。入力ファイルはごく普通のテキストファイルで、Windows標準のメモ帳で編集することができます。
MOPACのキーワードは膨大な数に上り、とても全てを紹介することはできません(そもそも筆者が全てのキーワードを使いこなしてはいません)。ここでは、当サイトで使用頻度の高いキーワードに絞って紹介します。具体的な使い方は実践の項で。
分子軌道計算の入力には、当然分子構造の入力が必要です。分子構造の記述はいろいろと考案 され、現在でもいくつかのフォーマットが平行して使われています。代表的なものを挙げると、Cartesian座標(直交座標)，MOPAC z-matrix，Gaussian z-matrixの3つが有名です。MOPACで主に用いるのはその名前通りMOPAC z-matrix(以下単にz-matrixと表記)です。
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