MP4のnumerical gradient

2016-01-04 0

Fireflyはver.8からnumerical gradientが実装されています。 どのプログラムでも大体実装されている機能ですが、ver.8からとは意外ですね。これを使えば、analytical gradientが実装されていないMP [→続きを読む]

年末年始は貴重な時間

2016-01-02 0

いつもこの時期に何か記事を上げている気がしますね。 ここのところ、RDkitの使い方を少しずつ勉強していたり、Prirodaの最新版のテストをしていたり。RDkitについては配座発生が中心ですが、どうも結果が変で試行錯誤中…… Python [→続きを読む]

今後の記事予告

2015-05-10 0

今後投稿(一部再投稿)していく予定のものを列挙。 Gabeditの使い方 励起状態の計算 芳香族性の見積もり BSSE 酸化的付加-還元的脱離 溶媒効果の考慮 Model chemistryの選択

分子軌道を表示する

2015-05-10 0

パソコン上で分子の計算をしようと思うきっかけの一つは、いろいろな分子の形だけでなく、その分子軌道の様子を観察したいということではないでしょうか。 最近の有機化学の教科書では、模式的な軌道図だけではなく綺麗なグラフィックで描かれた分子軌道も掲 [→続きを読む]

ORCAの入手とセットアップ

2015-05-06 0

※最新情報や、Windows Subsystem for Linux (WSL)上で動かす場合の環境設定はBlogも参照ください。 ORCAはMax Planck研究所のORCAのページから入手することができます。 左側のUser Menu [→続きを読む]

リンク集

2015-05-04 0

自分用に、よく参照する計算化学関係のリンクをまとめました。 (最終更新:2018/12/31) 【MO/DFプログラム】 GAMESS(US) [ http://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/ ] GAME [→続きを読む]

GAMESS(2014R1)のコンパイル

2015-03-28 0

現在GAMESS(US)の最新版は2014.12.5(R1)ですが、windows用バイナリはまだ公開されていません。 いろいろ気になる追加もあるので、自分でコンパイルしてみました。 コンパイルはPGI Workstation 14.10を [→続きを読む]

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