小さなタンパクのエネルギー計算

2017-03-28 0

ORCA 4.0.0では大きな分子でも高精度計算が可能になってきていて、タンパク質レベルのサイズでもMP2計算ができます。 手頃なところで、PDBに登録されているCyclotideの1種(3E4H)を例にやってみました。 水分子を取り除いた [→続きを読む]

筆者のハード/ソフト環境

2017-03-27 0

◆2017/3/27現在 64GBという比較的大容量メモリを運用を数年行っていますが、特にエラーもなく安定しています。CPU温度は最高で75 ℃程度、通常はピーク時でも70 ℃前後です(簡易水冷)。 Scratch diskとしてSamsu [→続きを読む]

ORCA ver.4.0.0リリース

2017-03-20 0

ORCAの最新版がリリースされましたね。 今回のアップデートはかなり大きなもので、release notesを見るだけでもwkwkします。 しかし、ダウンロードが重くて失敗しまくります。 まったり待ちましょう。