pc-chem.infoとは何か

このサイトは、一般的なWindows PC上にお金を掛けずに計算化学環境を構築し、様々な計算(特に有機化学周辺)を行う方法などをまとめているものです。最近はLinuxも使い始めていますが…
量子化学計算プログラムとしてはMOPAC, GAMESS(GAMESS(US), PC GAMESS/Firefly)を中心に、可視化/モデリングソフトとしてはWinmostarを主に用いています。

私(s2k)の専門が有機合成であるため、その周辺分野に内容は偏っています。

Posted by: s2k | Date: 09/06/08, 20:34 | | Comment (0)

筆者の計算環境

[2010/02/20現在]

Windows機
CPUCore2 Quad Q9300 (2.50 GHz)
M/BGA-G33M-DS2R (G33)
RAMDDR2-800 8GB (2GBx4)
HDDSATA2 500GB/7200rpm
OSWindows Vista Business (32bit)
※RAMのうち4.7 GBをRAMディスクとして利用

Linux機
CPUCore2 Extreme QX9650 (3.00 GHz)
M/BP5K PRO (P35)
RAMDDR2-800 8GB (2GBx4)
HDDSATA2 500GB/7200rpm [system]
SATA2 80GB(Intel製SSD)x2 (RAID0) [scratch1]
SATA2 128GB(Samsung製SSD)x2 (RAID0) [scratch2]
SATA2 16GB(ANS-9010) [swap]
OSCentOS 5.4 (x86_64)
MPIOpenMPI 1.4.1
※冬場は10%ほどOCして利用
※Linux機はWindows機から制御(TeraTerm + FFFTP)

プログラムのバージョン
MOPAC6.06, 7.1(2006/08)
GAMESS(US)2009.01(R3)
PC GAMESS/Firefly7.1.G
ORCA2.7.0
PRIRODA6(2006/08/20)
ABINIT-MP4.2(2009/06/01)

Posted by: s2k | Date: 09/06/08, 20:44 | | Comment (0)

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