NMR化学シフトの高速計算
分光学的に測定される分子のプロパティの中で、NMR(核磁気共鳴)スペクトルは有機化学者にとって最もなじみ深いものではないでしょうか。化合物の構造決定において、X線結晶構造解析、質量分析と並び極めて重要な位置を占めています。 量子化学計算プロ [→続きを読む]
1月 2019
NWChem 6.8.1のWSLへのインストール
メモ書き。Ubuntu 18.04 LTS (bionic)の場合です。 Ubuntu向けdebパッケージは下記URLからダウンロードできます。 https://github.com/nwchemgit/nwchem/releases/ta [→続きを読む]
GFN-xTBを使う
メモ書きです。 最新のORCAにはGrimmeらのGFN-xTBプログラムが同梱されています。実行ファイルとしてはotool_xtbがこれに相当し、非常に高速な構造最適化や振動解析、MD等が実施可能です。-hオプションで簡単なマニュアルは見 [→続きを読む]
orca_mapspc→gnuplotでIRスペクトル画像生成
ORCAには標準出力ファイルからスペクトルの描画用ファイルを生成するツール(orca_mapspc)があります。で、これとgnuplotを使えば、さくっとスペクトルのpng画像を作れます。バッチファイルの一例。 :ir_start if ‘ [→続きを読む]