Blog – pc-chem.info

2020-02-05 0

Fireflyの開発者であるAlex A. Granovsky先生が、昨年末に逝去されたと知りました。このサイトの黎明期から、Firefly (PC GAMESS)は、貧弱なPCでも高速にab initio MO計算を走らせることができる [→続きを読む]

2019-01-04 0

メモ書き。Ubuntu 18.04 LTS (bionic)の場合です。 Ubuntu向けdebパッケージは下記URLからダウンロードできます。 https://github.com/nwchemgit/nwchem/releases/ta [→続きを読む]

2019-01-02 0

メモ書きです。最新のORCAにはGrimmeらのGFN-xTBプログラムが同梱されています。実行ファイルとしてはotool_xtbがこれに相当し、非常に高速な構造最適化や振動解析、MD等が実施可能です。-hオプションで簡単なマニュアルは見 [→続きを読む]

2019-01-01 0

ORCAには標準出力ファイルからスペクトルの描画用ファイルを生成するツール(orca_mapspc)があります。で、これとgnuplotを使えば、さくっとスペクトルのpng画像を作れます。バッチファイルの一例。 :ir_start if ‘ [→続きを読む]

2018-12-29 0

いろいろと苦労したのでメモ。 ORCAのパスはC:\orca (/mnt/c/orca)と仮定。 ①必要なプログラムのインストール OpenMPIが必須だが、Ubuntu 18.04 LTSならば sudo apt-get install [→続きを読む]

2017-07-30 0

先週、ORCAのマイナーバージョンアップ(4.0.0.2→4.0.1)がありました。すでに全バイナリがダウンロード可能になっていますので、早速私もアップデートしてみました。今回のアップデートは機能強化はなく、バグ修正のみということですが、 [→続きを読む]

2017-06-18 0

世に量子化学計算プログラムは沢山ありますが、Windows環境でフリーで利用できるものはそう多くありません。そんな中、このBlogではBash on Ubuntu on Windowsを使うことでその選択肢を広げられることを紹介してきまし [→続きを読む]

2017-05-01 0

プログラムはCPUやメモリだけでなく、ストレージも使います。ときにはストレージのI/O性能が足を引っ張って、計算に時間がかかってしまうことも。私が普段使っているPCには、普通のデータ保存用HDDと、高回転のHDDを2台RAID0に組んだス [→続きを読む]

2017-05-01 0

DLPNO-MP2はRI-MP2とどれくらい違うか比較。小さい分子は純粋な計算時間以外のオーバーヘッドがあるので、スケーリング算出は時間かかる側5分子のデータを使っています。 RIはconventionalに比べて計算時間が1/10になる [→続きを読む]

2017-04-18 1

ORCAはver.4からGIAO法によるNMR化学シフト計算を行うことができます。恒例のベンチマークとして、StrychnineとTriamcinolone Acetonideの2分子の計算をしてみました。構造最適化はPBE0/Def2 [→続きを読む]