小さなタンパクのエネルギー計算
ORCA 4.0.0では大きな分子でも高精度計算が可能になってきていて、タンパク質レベルのサイズでもMP2計算ができます。 手頃なところで、PDBに登録されているCyclotideの1種(3E4H)を例にやってみました。 水分子を取り除いた [→続きを読む]
3月 2017
筆者のハード/ソフト環境
◆2019/8/22現在 ついにメモリを128GBに増量し、Intel環境からAMD環境に変えました。ケースも変えて、ATXフォームファクタとしてはコンパクトになっています。CPUのTDPが下がったこともあり、冷却も簡易水冷から空冷に戻しま [→続きを読む]
ORCA ver.4.0.0リリース
ORCAの最新版がリリースされましたね。 今回のアップデートはかなり大きなもので、release notesを見るだけでもwkwkします。 しかし、ダウンロードが重くて失敗しまくります。 まったり待ちましょう。