PC-GAMESSでDualCore CPUをフル活用。

[本記事は私が以前書いていたblogからサルベージしたものです]

モスクワ州立大のAlex A. Granovsky教授が開発している「PC-GAMESS」は、GAMESS-USの傍系で、独自のFeatureを加え、さらにCPU毎に最適化が行われています。
さらに、並列計算をサポートしていますので、SMPシステムやDualCore CPUを搭載しているPCを持っている場合、その計算資源をフル活用して計算時間を短縮することができます。

そこで！

Athlon 64 X2 4400+使ってるんですから、並列計算でCPU使用率100%を目指すしかないでしょう！

ちなみに、こちらの記事を参照して、その通りにやれば、簡単に並列化できます。ですので、詳細はそちらを参照ください。

では、その効果をば。
計算対象は、Pd(CN)₄^2-という、平面正方形のアート錯体です。PC-GAMESS 6.4 (for Pentium II / Athlon / Opteron)で、RB3LYP/631LANで構造最適化計算を行い、並列化した場合とSingleで行った場合を比べてみると、

1CPU : 333.9 SECONDS ( 5.6 MIN)
2CPU : 187.6 SECONDS ( 3.1 MIN)

というわけで、1.78倍速く終了しました。単純に2倍とはいきませんが、かなりの高速化です。寝てる間に…なんていう計算は並列で実行すると良いかも。

欠点としては、他のことができなくなるぐらいでしょうか。
(もっとも、優先度を下げれば他のプログラムも動かせますが…面倒くさい)